Mortal Kombat 11 está directamente relacionado con los acontecimientos del décimo juego de la serie. Shinnok ha sido derrotado, pero no sin antes infectar con éxito a Jinsei, la fuerza vital de Earthrealm. Raiden ha conseguido limpiar desde dentro la fuente de toda vida, pero esta hazaña heroica no se ha llevado a cabo sin consecuencias: Raiden se enfrenta ahora a un poder maligno y, en su intento de proteger Earthrealm, se convierte en un extremista cruel y frío. Asqueado por las constantes amenazas y enfadado por los dioses inactivos, Raiden da un paso radical y decide derrotar a Shinnok, pero no para matarlo, sino para dejarle sin poder. Shinnok revela entonces a una misteriosa mujer llamada Crónica y anuncia que está dispuesta a castigar a Raiden por romper la estabilidad del tiempo.